洁净厂房的运行管理包括洁净室管理、人员管理、物品管理、厂房与设备管理以及洁净度的监测等。本章主要围绕这几方面的内容分别进行阐述。
　　洁净室的运行管理与定期检测：如果洁净室的设计和施工本身有缺陷，或者是即便设计和施工很完善，而维护管理和使用不当仍然起不到应有作用，同样会制造不出优质产品。有人认为，对产品的污染控制效果中，设备与管理各占50%。可见，运行管理制度的健全对产品质量何等重要。 净洁室的使用和定期检查：无菌操作室在使用中，必须注意下列几点：
　　1)尘埃和细菌尽量少带进无菌室中应将无菌室内的操作人员数量控制到最低限度，应严格限制操作人员以外的其他人员进入。
　　进入洁净室的人员应在更衣室更换无菌室专用工作服，手宜空气消毒 。更衣室的环境条件与传递室相同。从更衣室进入无菌室之前，宜经过空气吹淋。
　　进入无菌室的物品，首先要在无菌室外经过清洁处理后，按一次通过方式边灭菌边送入无菌室内。主要送入方式有如下几种：
　　a畅安瓿和药水瓶等，在生产流水线上经过洗涤和灭菌后连续送入无菌室。
　　b畅在贯通无菌室壁面的适当位置处安装灭菌器，从无菌制剂操作室外面将送入物品装入灭菌器，经过灭菌处理后在灭菌器内取出物品。
　　c畅将物品先放进传递室或窗，经过杀菌灯照射、喷消毒液等方式清洁灭菌后再进入无菌室。传递室或窗的内部通以经高效过滤器后送出的洁净空气，使无菌室外保持正压，无菌[3]室内保持相对负压，并连续用杀菌灯照射，使其保持准无菌室状态的洁净度 。
　　d无菌制剂操作室内的空气和设备的除尘和除菌　无菌室内的空气不断被高效过滤器过滤的洁净空气所置换，同时让室内始终保持正压，防止污染空气从外部流入。
　　无菌室的空调最好夜间也要运行。在昼夜连续运行时，为了节约运转费用，夜间可停止温湿度空调，只靠换气方式保证洁净度和正压即可。
　　但到第二天重新开始操作时，为了除湿，至少要提前1h开动温湿度空调装置。

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